Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSF1RP07333 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms