Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCCAP05165 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCCAP05165 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCCAP05165 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCCAP05165 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCCAP05165 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCCAP05165 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCCAP05165 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCCAP05165 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCCAP05165 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCCAP05165 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCCAP05165 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCCAP05165 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCCAP05165 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCCAP05165 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PCCAP05165 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCCAP05165 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCCAP05165 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCCAP05165 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCCAP05165 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCCAP05165 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCCAP05165 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCCAP05165 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCCAP05165 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCCAP05165 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCCAP05165 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCCAP05165 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCCAP05165 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCCAP05165 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCCAP05165 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCCAP05165 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCCAP05165 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCCAP05165 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCCAP05165 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCCAP05165 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCCAP05165 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCCAP05165 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCCAP05165 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCCAP05165 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCCAP05165 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCCAP05165 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCCAP05165 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCCAP05165 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCCAP05165 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCCAP05165 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCCAP05165 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCCAP05165 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCCAP05165 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCCAP05165 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCCAP05165 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCCAP05165 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms