Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFP01375 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFP01375 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFP01375 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFP01375 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFP01375 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFP01375 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFP01375 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFP01375 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFP01375 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFP01375 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFP01375 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFP01375 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFP01375 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFP01375 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFP01375 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFP01375 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFP01375 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFP01375 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFP01375 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFP01375 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFP01375 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFP01375 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFP01375 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFP01375 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFP01375 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFP01375 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFP01375 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms