Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSP01100 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSP01100 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOSP01100 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOSP01100 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOSP01100 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSP01100 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSP01100 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSP01100 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSP01100 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSP01100 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSP01100 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSP01100 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSP01100 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSP01100 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSP01100 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSP01100 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSP01100 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSP01100 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSP01100 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSP01100 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSP01100 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSP01100 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSP01100 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSP01100 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSP01100 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSP01100 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSP01100 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSP01100 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSP01100 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSP01100 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSP01100 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSP01100 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms