Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F13A1P00488 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
F13A1P00488 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F13A1P00488 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
F13A1P00488 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F13A1P00488 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
F13A1P00488 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
F13A1P00488 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F13A1P00488 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F13A1P00488 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F13A1P00488 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
F13A1P00488 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
F13A1P00488 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F13A1P00488 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
F13A1P00488 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F13A1P00488 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F13A1P00488 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F13A1P00488 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F13A1P00488 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F13A1P00488 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F13A1P00488 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F13A1P00488 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
F13A1P00488 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F13A1P00488 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F13A1P00488 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F13A1P00488 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F13A1P00488 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F13A1P00488 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F13A1P00488 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F13A1P00488 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F13A1P00488 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F13A1P00488 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
F13A1P00488 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
F13A1P00488 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F13A1P00488 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F13A1P00488 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F13A1P00488 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F13A1P00488 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F13A1P00488 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms