Protein–RNA interactions for Protein: P00445

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], yeast

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	P00445	YNG1	YOR064C	660 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YOR097C	YOR097C	528 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	FSH3	YOR280C	801 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	SRL4	YPL033C	846 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	SET6	YPL165C	1122 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	CSH1	YBR161W	1131 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	TRM11	YOL124C	1302 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	HFA1	YMR207C	6372 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	RFT1	YBL020W	1725 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	THI22	YPR121W	1719 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	RKM2	YDR198C	1440 nt		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YDL109C	YDL109C	1944 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	SRP72	YPL210C	1923 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	IZH3	YLR023C	1632 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	CPR1	YDR155C	489 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	EFB1	YAL003W	621 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	CNB1	YKL190W	528 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	SHE1	YBL031W	1017 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	FAR3	YMR052W	615 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YAP7	YOL028C	738 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	IAH1	YOR126C	717 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	PNT1	YOR266W	1272 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	VPS69	YPR087W	321 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	GRX1	YCL035C	333 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	APA1	YCL050C	966 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YDR444W	YDR444W	2064 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	ARG4	YHR018C	1392 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	STB3	YDR169C	1542 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	API2	YDR525W	330 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	KRE28	YDR532C	1158 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	KXD1	YGL079W	657 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	SDT1	YGL224C	843 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	LSB1	YGR136W	726 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	TTI2	YJR136C	1266 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YNK1	YKL067W	462 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	MTD1	YKR080W	963 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	PER33	YLR064W	822 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YLR156W	YLR156W	345 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YLR159W	YLR159W	345 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YLR161W	YLR161W	345 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	GAB1	YLR459W	1185 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YML119W	YML119W	1074 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YMR084W	YMR084W	789 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	IZH4	YOL101C	939 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	YOL118C	YOL118C	309 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	CBP6	YBR120C	489 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	AVT1	YJR001W	1809 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	P00445	PHO12	YHR215W	1404 nt		3.34	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	PHO11	YAR071W	1404 nt		3.34	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	RPB2	YOR151C	3675 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	UBP7	YIL156W	3216 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	AZR1	YGR224W	1842 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	UBC1	YDR177W	648 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	PLP1	YDR183W	693 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	YGL199C	YGL199C	471 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	CUP1-1	YHR053C	186 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	CUP1-2	YHR055C	186 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	NSE1	YLR007W	1011 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	RPS10B	YMR230W	318 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	RRN9	YMR270C	1098 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	YBR196C-B	YBR196C-B	105 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	ORC6	YHR118C	1308 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	ECM18	YDR125C	1362 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	YHR177W	YHR177W	1362 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	TCM62	YBR044C	1719 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	GDH2	YDL215C	3279 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	LYS2	YBR115C	4179 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	DIP2	YLR129W	2832 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	MRP4	YHL004W	1185 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	YIL102C-A	YIL102C-A	228 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	CMC1	YKL137W	336 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	VPS20	YMR077C	666 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	YBL059W	YBL059W	582 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	SPS19	YNL202W	879 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	SPS18	YNL204C	903 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	YBL094C	YBL094C	333 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	MVD1	YNR043W	1191 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	IPP1	YBR011C	864 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	SPS4	YOR313C	1017 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	GRX5	YPL059W	453 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	SAD1	YFR005C	1347 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	DBP5	YOR046C	1449 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	BDP1	YNL039W	1785 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	PMT5	YDL093W	2232 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	MNL1	YHR204W	2391 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	SUM1	YDR310C	3189 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	FOX2	YKR009C	2703 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	YLR152C	YLR152C	1731 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	MMT1	YMR177W	1533 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	RRP8	YDR083W	1179 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	URA5	YML106W	681 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	EAF7	YNL136W	1278 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	RPS19A	YOL121C	435 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SOD1	P00445	MED7	YOL135C	669 nt		3.31	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.2 ms