Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP4O95707 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP4O95707 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP4O95707 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP4O95707 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP4O95707 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP4O95707 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POP4O95707 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POP4O95707 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP4O95707 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POP4O95707 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP4O95707 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP4O95707 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP4O95707 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP4O95707 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP4O95707 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP4O95707 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP4O95707 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP4O95707 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP4O95707 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP4O95707 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP4O95707 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP4O95707 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP4O95707 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP4O95707 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POP4O95707 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms