Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC24BO95487 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms