Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24AO95486 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms