Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms