Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RAPGEF3O95398 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAPGEF3O95398 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAPGEF3O95398 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAPGEF3O95398 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF3O95398 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
RAPGEF3O95398 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms