Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAPBO95292 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VAPBO95292 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VAPBO95292 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VAPBO95292 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VAPBO95292 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAPBO95292 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VAPBO95292 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAPBO95292 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPBO95292 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPBO95292 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPBO95292 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPBO95292 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VAPBO95292 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPBO95292 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPBO95292 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms