Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMO75781 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMO75781 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMO75781 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMO75781 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMO75781 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMO75781 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMO75781 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMO75781 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMO75781 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMO75781 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMO75781 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMO75781 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMO75781 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMO75781 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMO75781 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMO75781 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMO75781 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMO75781 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMO75781 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMO75781 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMO75781 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMO75781 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMO75781 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMO75781 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMO75781 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMO75781 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMO75781 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMO75781 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMO75781 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMO75781 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMO75781 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms