Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP5O75197 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP5O75197 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP5O75197 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP5O75197 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP5O75197 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP5O75197 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP5O75197 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRP5O75197 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRP5O75197 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRP5O75197 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP5O75197 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP5O75197 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP5O75197 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP5O75197 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP5O75197 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP5O75197 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP5O75197 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP5O75197 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP5O75197 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP5O75197 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP5O75197 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP5O75197 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP5O75197 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP5O75197 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP5O75197 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP5O75197 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP5O75197 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP5O75197 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP5O75197 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP5O75197 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP5O75197 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP5O75197 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP5O75197 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP5O75197 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP5O75197 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP5O75197 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP5O75197 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP5O75197 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP5O75197 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP5O75197 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP5O75197 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP5O75197 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP5O75197 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP5O75197 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP5O75197 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP5O75197 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms