Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN3O60664 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN3O60664 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN3O60664 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN3O60664 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN3O60664 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN3O60664 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN3O60664 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN3O60664 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN3O60664 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms