Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR5O60602 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR5O60602 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR5O60602 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR5O60602 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR5O60602 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR5O60602 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR5O60602 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR5O60602 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR5O60602 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR5O60602 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLR5O60602 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLR5O60602 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR5O60602 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR5O60602 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR5O60602 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR5O60602 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR5O60602 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR5O60602 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR5O60602 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR5O60602 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR5O60602 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR5O60602 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR5O60602 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR5O60602 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms