Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG3O60359 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG3O60359 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms