Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX6O43752 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX6O43752 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STX6O43752 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX6O43752 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX6O43752 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX6O43752 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX6O43752 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX6O43752 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX6O43752 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX6O43752 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX6O43752 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX6O43752 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX6O43752 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX6O43752 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX6O43752 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX6O43752 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX6O43752 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STX6O43752 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX6O43752 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX6O43752 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX6O43752 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX6O43752 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX6O43752 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX6O43752 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX6O43752 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX6O43752 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX6O43752 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms