Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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