Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIAH2O43255 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIAH2O43255 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIAH2O43255 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIAH2O43255 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIAH2O43255 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIAH2O43255 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIAH2O43255 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIAH2O43255 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIAH2O43255 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIAH2O43255 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIAH2O43255 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIAH2O43255 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIAH2O43255 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIAH2O43255 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIAH2O43255 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIAH2O43255 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIAH2O43255 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms