Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOCS1O15524 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOCS1O15524 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms