Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms