Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLGNO14967 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLGNO14967 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLGNO14967 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLGNO14967 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLGNO14967 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLGNO14967 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLGNO14967 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLGNO14967 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLGNO14967 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLGNO14967 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLGNO14967 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms