Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASKO14936 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASKO14936 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASKO14936 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASKO14936 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASKO14936 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASKO14936 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASKO14936 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASKO14936 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASKO14936 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASKO14936 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASKO14936 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASKO14936 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASKO14936 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASKO14936 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASKO14936 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASKO14936 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASKO14936 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASKO14936 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASKO14936 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASKO14936 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASKO14936 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASKO14936 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASKO14936 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASKO14936 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms