Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC80O14777 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC80O14777 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDC80O14777 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDC80O14777 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDC80O14777 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDC80O14777 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC80O14777 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC80O14777 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC80O14777 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC80O14777 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC80O14777 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC80O14777 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC80O14777 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC80O14777 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC80O14777 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC80O14777 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC80O14777 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC80O14777 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC80O14777 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC80O14777 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC80O14777 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC80O14777 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC80O14777 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC80O14777 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC80O14777 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDC80O14777 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDC80O14777 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDC80O14777 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms