Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APAF1O14727 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
APAF1O14727 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
APAF1O14727 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
APAF1O14727 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
APAF1O14727 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APAF1O14727 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APAF1O14727 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APAF1O14727 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APAF1O14727 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APAF1O14727 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APAF1O14727 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
APAF1O14727 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APAF1O14727 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APAF1O14727 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APAF1O14727 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APAF1O14727 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APAF1O14727 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APAF1O14727 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APAF1O14727 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APAF1O14727 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
APAF1O14727 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
APAF1O14727 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
APAF1O14727 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APAF1O14727 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
APAF1O14727 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APAF1O14727 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
APAF1O14727 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APAF1O14727 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APAF1O14727 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms