Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F3O00716 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F3O00716 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F3O00716 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F3O00716 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F3O00716 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F3O00716 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F3O00716 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F3O00716 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F3O00716 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F3O00716 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F3O00716 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E2F3O00716 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms