Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B1O00203 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms