Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP23O00161 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms