Protein–RNA interactions for Protein: I3L0E3

hCG_1984214, HCG1984214, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_1984214I3L0E3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
hCG_1984214I3L0E3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms