Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C1W4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C1W4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C1W4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C1W4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C1W4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C1W4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C1W4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C1W4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C1W4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
H7C1W4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H7C1W4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H7C1W4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
H7C1W4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H7C1W4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
H7C1W4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
H7C1W4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
H7C1W4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1W4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1W4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1W4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1W4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1W4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1W4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1W4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1W4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1W4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C1W4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C1W4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C1W4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C1W4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C1W4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1W4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1W4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms