Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C0C1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C0C1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C0C1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C0C1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C0C1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C0C1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C0C1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C0C1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0C1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0C1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0C1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0C1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0C1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0C1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0C1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0C1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C0C1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C0C1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C0C1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms