Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFI1A8K8P3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms