Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBY3A6NI87 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms