Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms