Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIPSLA2A3N6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms