Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F8A0AVK6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms