Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RSPH3-203ENST00000449822 1904 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 BCL11A-202ENST00000356842 3959 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PRAMEF12-201ENST00000357726 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TTC8-207ENST00000536576 2209 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DIS3L2-204ENST00000409307 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MRVI1-215ENST00000541483 2468 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LINC01149-202ENST00000430364 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TUBD1-216ENST00000613721 2184 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 POC5-213ENST00000514838 1984 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 METTL4-203ENST00000574538 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 LINC01001-201ENST00000526704 2553 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 AC027801.2-201ENST00000515692 1816 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CHRNA7-224ENST00000637183 2912 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SGK1-204ENST00000367858 3201 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FOSB-201ENST00000353609 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DNAJC2-204ENST00000412522 3033 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 GRK1-201ENST00000335678 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SIGLEC10-206ENST00000441969 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 COG4-201ENST00000323786 2833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TCF7-203ENST00000395023 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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