Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC104435.2-201ENST00000478745 866 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC113391.1-201ENST00000507236 578 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 534.8 ms