Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC079905.2-201ENST00000550105 247 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC003991.1-211ENST00000631117 870 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZSCAN29-201ENST00000396972 2831 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC091198.1-201ENST00000591558 2492 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC073133.2-201ENST00000436670 2698 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 THEMIS3P-201ENST00000416112 1586 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SUCLG2-AS1-202ENST00000482677 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MEOX1-201ENST00000318579 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 VOPP1-208ENST00000433959 2900 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TNFAIP3-209ENST00000619035 2267 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PPEF2-201ENST00000286719 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MSR1-205ENST00000445506 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MIP-201ENST00000257979 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 BEND3P1-202ENST00000449695 2762 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MED8-203ENST00000372457 1924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PTGFR-202ENST00000370757 4379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CIITA-212ENST00000618207 2844 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 NVL-201ENST00000281701 3123 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AL590434.1-201ENST00000641402 1886 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FOSB-210ENST00000591858 3658 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CAMK1G-201ENST00000009105 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MS4A14-209ENST00000531787 2537 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms