Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 OR13A1-202ENST00000536058 2023 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IL1RN-204ENST00000409052 1903 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 OR10N1P-203ENST00000641736 1305 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL357509.1-201ENST00000641892 2013 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms