Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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