Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCINQ9Y6U3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCINQ9Y6U3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms