Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN6Q9Y6Q1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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