Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC42.8■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC42.77■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC42.71■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC42.7■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
DCAF1Q9Y4B6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC42.66■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms