Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms