Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms