Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC3Q9UQE7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms