Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SATB2Q9UPW6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms