Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms